首先我们来看看CMMI认证和ISO9001认证的区别：CMMI大体包含了ISO9001的一些要素，ISO9001也包括了一些CMMI的内容，二者有一定的重叠。企业实施CMMI与ISO9001的做法是相同的：都是要按照标准的要求编写流程文件；都是按照流程文件进行操作。
ISO9001和CMMI的不同点如下：
第一：ISO9000建立企业运行的完整的质量管理体系,适用于各个行业。CMMI是专门为软件开发而形成的改进模型,所以特别适用于软件企业和系统集成企业。
第二：ISO9001是第三方的认证活动，认证机构发证书并每年进行监督审核，公司内部要有内审、管理评审、纠正预防措施等管理活动。 CMMI是企业自己的改进活动，评估后可以由主任评估师签字，没有外部的后续监督活动，没有类似内审、管理评审、纠正预防措施等管理活动。
第三：ISO9000质量管理体系包含了全公司主要的业务运行各个环节(除了财务、人事、IT、行政），侧重于质量管理体系的运行和持续改进，通过管理水平的提高，最终达到提高产品质量的目的。CMMI包含的是软件生命周期或系统集成的管理活动，侧重于软件产品开发过程或系统集成的持续改进。
