如今水草问题已成为海参养殖的大敌，水草具有发生广，繁殖快，危害重，根治难等特点。水草问题不断严重，与往年相比，生长量更大，更不易被杀死。那么，为什么会出现这样的情况呢？
有以下几点原因：
1．海参的存圈量大幅增加，海参密度大，底质中的海参粪便多，阻碍了底栖硅藻层的光合作用，同时为水草提供了充足的养料。
2．人们为节约用药成本大幅度减少了底改用品的使用量，致使水底有机物氧化分解速度减慢至停滞。
3．清圈不及时，淤泥逐年增厚，为水草提供营养。
4．杀草药的使用频率和用量的加大，使得水草的耐药性越来越强，水草属低等生物，对杀灭药物的刺激会产生适应性的进化和变异，从而增强了自身的耐药性，因杀草导致海参化皮、吐肠乃至闷圈的例子也屡见不鲜。
处理水草的方法
目前处理水草的方法有三种，
第一是杀。用杀草药直接将草杀死，用以扑草净、西草净、百草枯等为有效成分的药物杀灭，这种方法的特点是见效快，但长期使用治标不治本，越用草复发越快；刺激性大，影响海参和套养虾的产量；杀灭水中藻类和菌类，水难肥；安全性不可控；易产生耐药性，使用量逐次增加；杀草后还需进行捞草、换水、改底甚至解毒。
第二是捞。但活的水草用捞来处理是扬汤止沸，水草的生长速度极快，有时头一天刚捞过第二天又长满了，甚至会将没长草的地方也传播上水草，人工成本巨大且收效甚微。
第三是控。即用生物制剂控制水草逐渐枯萎死亡，在相当一段时间内不长或生长较慢，且使用水草的复发率越来越低直至不再暴发，这也正是目前处理水草问题的发展方向。
