紫外线杀菌的杀菌原理是利用紫外线光子的能量破坏水体中的各种病毒，细菌以及其它致病体的DNA的结构。主要是使DNA中的各种结构键断裂或发生光化学聚合反应，例如使DNA中THYMINE二聚，从而使各种病毒，细菌以及其它致病体失去复制繁殖能力，达到灭菌的效果。本紫外线消毒系统可根据水位的变化，自动关闭处于水位之上的灯管，防止灯管在无水的情况下，长时间点亮而引起不必要的损坏，也为在低水位时，达到相同消毒效果而不必改变单只灯管功率。既节约能源，又能使辐照能量达到所需剂量。当水位上升时，便自动打开相对应的灯管。
紫外线杀菌系统设计时必须考虑的重要因素：
1、 处理水量：包括设计水量，平均流量及流量变化系数均对处理效果产生重要影响；
2、 紫外线灯客选型：即使总的有效输出功率相当，灯管类型及数量上的差异都对杀菌效果产生重要影响；
3、 水质指标：主要指标包括原水的悬浮物浓度，悬浮物粒径，浊度，UVC透过率，细菌含量等；
4、 其它因素：包括设备使用的环境因素（如温度，湿度），用户其它特殊要求（如系统安装方式等）
