在污水厂的实际使用过程中，现场存在多种因素影响次氯酸钠作为消毒剂的使用效果，比较常见的有：
1、污水处理程度：污水处理的程度越深，处理水水质越好，需要的消毒剂越少。
2、次氯酸钠与水的混合方式。次氯酸钠与污水的混合越激烈，接触越彻底，消毒的效果越明显，消毒剂的使用量也就越少。比如在深度处理出水管上安装消毒剂投加管，在接触池内设置上下隔板加大水的紊流状态等。
3、接触时间。接触时间和消毒效果在上文中有专门的公式描述，接触时间越长消毒效果越好。
4、污水温度。污水温度每升高15℃，消毒剂的反应速度提高一倍，接触时间可减少一半；反之降温15℃速度则降低一倍。
5、PH值。PH值越低，消毒效果越好。
6、其他干扰物质。干扰物质会影响次氯酸钠的消毒作用，比如当水中含有大量铁盐的时候，次氯酸钠的效果下降明显。这也是污水厂过量投加铁盐除磷剂，会导致次氯酸钠的效果下降的原因。
随着监管部门的严格要求，次氯酸钠在污水厂内的消毒的使用越来越广泛，了解和管理次氯酸钠的使用是每个使用次氯酸钠的污水厂应该进行的工作。
