保税区内保税仓库，具有以下仓储功能：
一、储存保税区内贸易企业和本企业从国外进口的保税货物，办理视同出口手续后的国内货物；
二、储存所有权属境外公司的进口保税货物；
三、存放区内加工企业向海关办理过出口手续的加工产品；
区内保税仓库储存的保税货物，可以在仓库内进行货物分级、挑选、刷贴标志、改换包装形式等简单加工，但不能改变其原来商品物理属性，也不允许产生损耗。
海关对保税区内保税仓库实行联网管理，经营企业须配置海关的仓库计算机管理软件、使用统一的台帐及提货单。海关有权对保税仓库所储存的保税货物进行检查。
办事依据
《中华人民共和国海关法》
《中华人民共和国保税区海关监管办法》
办事程序
企业向保税区海关提出申请，交验以下单证：
（一）企业申请设立区内仓库/物流分拨中心的书面申请报告；
（二）企业海关注册登记证书（复印件）；
（三）工商营业执照（复印件）；
（四）自建仓库产权证或租赁仓库合同、库位平面图；
（五）仓库管理人员名单、联系地址和电话。
（六）建立分拨中心另需提供经海关总署归类中心上海分中心核准的商品HS编码归类表一份。
第二步：保税区海关对有关文件进行审核，符合规定的，即予办理登记手续并发放《保税区内仓库登记证书》。
第三步：保税区海关进行实地勘察，核发《进库登记簿》。
办事对象义务
一、应具备的资格
（一）具有仓储经营场所,并经保税区管理委员会和保税区工商处批准，具备仓储业务经营权；
（二）经保税区公安处消防科勘查其核准;
（三）已经保税区海关登记注册。
二、需交验的单证：
（一）企业申请设立区内仓库/物流分拨中心的书面申请报告；
（二）企业海关注册登记证书(复印件)；
（三）工商营业执照（复印件）；
（四）自建仓库产权证或租赁仓库合同、库位平面图；
（五）仓库管理人员名单、联系地址和电话。
（六）建立分拨中心另需提供经海关总署归类中心上海分中心核准的商品HS编码归类表一份。
三、企业在次领取《进库登记簿》3个月之内发生有关业务，并每月按时核销。
四、保税区内仓库所有保税货物应有序堆放，未经海关批准不得擅自发货，有关进出库有效单证应保存完好。
办事机构义务
海关对企业交验的有关文件进行审核，符合有关规定的，核发《进库登记簿》。
办事机构
保税区海关
办事时限
备案单证手续，当日即可签发保税仓库批准证书。
