互联网药品信息服务资格证办理流程如下：
1、申请：进入政务服务窗口，并且填写相关信息和材料；
2、提交材料：申请人政务服务窗口提交申请材料；
3、受理和审查：当天对申请人提交的材料进行审查，符合要求的予以受理。不符合要求的不予受理；
4、发放备案凭证：申请材料符合要求的，申请人当天在政务服务窗口领取备案凭证。
申请互联网药品信息服务资格证需要以下材料：
1、营业执照副本、法人身份证明、负责人身份证明、医药相关人员学历证明、技术资格证书、简历等；
2、公司介绍、网站栏目设置说明、信息安全保障措施、药品信息管理制度、执行情况说明等；
3、域名证书或者网站IP地址证书、网站接入协议书、服务器托管协议等相关资质材料；
4、药品相关人员的劳动合同和社会保险证明等；
5、安全保障技术方案、网站发布历史信息备份和查阅相关制度以及执行情况说明等；
6、如果网站涉及互联网诊疗服务，则还需要提交互联网诊疗资质材料。
综上所述，以上材料仅供参考，具体要求可能会因地区和部门的要求而略有不同。建议在申请前仔细阅读相关网站上的申请指南，并咨询当地相关部门的具体要求。
法律依据：
《互联网食品药品经营监督管理办法》第七条
除法律法规规定不需要办理相关证照的经营主体外，互联网食品药品经营者应当取得食品药品经营许可或者备案凭证；取得食品、保健食品、化妆品、医疗器械生产许可或者备案凭证的企业，可以通过互联网销售本企业生产的产品。药品生产企业、药品批发企业不得通过互联网向个人消费者销售药品。互联网食品药品经营者不得委托他人从事互联网食品药品经营。
