秸秆堆肥包括高温堆腐和菌剂堆腐两种形式。高温堆腐是过去较常用的一种堆肥方法，但由于秸秆主要由木质素、纤维素、半纤维素等组成，所以传统的堆肥时间长，不利于养分的保存和利用。因此现在普遍采用微生物发酵剂堆腐技术，通过有益菌的作用缩短腐熟时间，堆腐时间一般只需20～30天。
秸秆腐熟剂是一种高温快速堆肥复合菌剂，可使玉米秸秆温度很快上升，快速、充分发酵腐熟，15天左右即可完全腐熟。通过持续高温和微生物平衡，堆料中的有害菌、虫卵、草籽等农作物有害生物被杀灭，并抑制病原菌再次滋生。有机肥发酵剂中的功能菌能够分解肥料中的有机质，解磷，解钾等，提高营养成分。秸秆中的有机质被分解成小分子易吸收的物质，更容易被农作物吸收。发酵后的有机肥料中含有大量功能性微生物，能够促进作物根系生长，并且改良土壤，建立土壤微生态平衡，增强植物抵抗力。
使用秸秆腐熟剂发酵秸秆做有机肥的方法：
1.把秸秆用粉碎机粉碎或用铡草机切断，一般长度以1-3CM为宜，
2将益富源秸秆腐熟剂加水均匀喷洒到粉碎的秸秆上，要浇湿，渗透，秸秆含水量一般控制在50%左右，即手抓紧有水渗出但不滴水，落地能散开。
3.将拌好的玉米秸秆以长方形打堆，宽2米，高1.5米，长度不限，发酵过程为有氧发酵，15-20天即可发酵成功，冬季需要延长发酵时间。
也可以将秸秆与鸡粪等禽畜粪便混合发酵，有利于控制发酵堆的透气性，避免透气过大养分流失，透气太差接触不到氧气发酵不好。
