步骤一、申请阶段。申请人申请卫生行政许可，应当按照法定程序和要求向当地卫生行政部门提出申请，可以委托代理人提出申请，但应当提供委托代理证明。申请人应当如实向卫生行政部门提交关材料，并对其申请材料的真实性负责，承担相应的法律责任。
步骤二、受理阶段。卫生行政部门接收申请时，要对申请事项是否需要许可、申请材料是否齐全等进行核对，并根据情况分别作出处理：不受理、当场更正、补正申请材料、受理。卫生行政许可决定作出前，申请人要求撤回申请，可以撤回。
步骤三、审查阶段。卫生行政部门受理申请后，要对申请人提交申请材料进行审查。由于不同的法律要求，所以审查申请材料的方式也不同。
步骤四、听证阶段。需要说明一点，该阶段并不是每种卫生许可必经环节。只法律规定实施卫生行政许可应当听证的事项，或者卫生行政部门认为需要听证的卫生行政许可事项，卫生行政部门作出卫生行政许可决定前向社会公告，并举行听证。
步骤五、决定阶段。经过审查，可分以下情况处理：1、依法应当逐级审批卫生行政许可，下级卫生行政部门应当法定期限内按规定程序和要求出具初审意见，并将初步审查意见和全部申报材料报送级卫生行政部门审批;2、符合要求的在法定期限内作出卫生行政许可决定，依法需要颁发卫生行政许可证件的，向申请人颁发加盖卫生行政部门印章的卫生行政许可证件。3、不符合要求的，作出不予卫生行政许可的书面决定，并说明理由，告知申请人享依法申请行政复议或者提起行政诉讼的权利。
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