国家开放大学体系结构和运行机制如下：
总部
五棵松校区总部总部设在北京,依托中央广播电视大学组建，直属教育部管理。总部由理事会、校务委员会、咨询委员会、学术委员会、质量保证委员会,以及相关教学、科研、服务等职能部门组成。总部的主要职责是：研究制定大学发展规划、方针政策、工作规程、质量标准；组织协调开展教学、科研、服务和国际交流合作；统筹协调专业、课程和学习资源建设；开展教学质量检查评估等工作。
分部
分部是国家开放大学总体架构中的重要组成部分，是国家开放大学设立在省级区域的教学与管理机构。分部与所依托的省级电大，按照“一套人马、两块牌子”运行，即在省级广播电视大学的基础上，加挂国家开放大学分部牌子。省级电大原有的人、财、物隶属关系和行政管理关系不变，与中央电大原有的教学业务关系不变。分部校长由依托建设的省级电大校长担任。分部的主要职责是：根据总部的相关政策规定，研究、制定分部的具体发展规划和相关政策；设置、管理所属地方学院及学习中心；组织开展各项教学、科研、服务，以及相关教学资源、特色专业和课程建设和质量检查、评估等工作。
地方学院
地方开放大学(4)根据国家开放大学地方学院设置标准，国家开放大学委托分部在所属区域内设立若干直属和相对独立的地方学院。学院的主要职责是：制定具体发展规划和政策；组织招生、考试和相关教学管理、质量检查工作；与学院所在地相关部门、企业等单位合作，充分利用国家开放大学各类学习资源和培训项目，大力开展相关职业教育、社区教育等非学历继续教育工作。
