杀菌的原理是在一定温度范围内，温度越低，细菌繁殖越慢;温度越高，繁殖越快。但温度太高，细菌就会死亡。不同的细菌有不同的 适生长温度和耐热、耐冷能力。巴氏消毒其实就是利用病原体不是很耐热的特点，用适当的温度和保温时间处理，将其全部杀灭。但经巴氏消毒后，仍保留了小部分无害或有益、较耐热的细菌或细菌芽孢。
巴氏奶加工设备是很多制作巴氏奶过程中必不可少的设备，主要的设备包括了制冷罐可以起到牛奶保鲜冷藏的作用，其次是过滤，过滤牛奶中的牛毛以及杂质，在经过一定的预热处理方便均质机制作出高品质的巴氏奶。 后就是经过巴氏杀菌机了，杀菌后就可以直接灌装处理。
牛奶加工过程奶需要先从冷存罐打入双联过滤器，双联过滤器过滤掉牛奶中的一些杂质，然后进入预热罐，预热罐升温到40度--60度左右，牛奶进入均质机，均质机在乳品均质中的工作原理主要是：粉碎牛奶中的脂肪球，使牛奶内部结构重新组合，从而结构更稳定，口感更细腻，颜色更好看更洁白。牛奶再进入巴氏杀菌机进行杀菌，巴氏杀菌机的杀菌温度在90度左右，然后牛奶进入预冷罐降温到40度左右，之后可以选择做酸奶就进入发酵罐，做牛奶就进入制冷罐。 产供应商的加工生产。 整套流水线有储存罐、双联过滤器、预热罐、均质机、巴氏杀菌机、预冷罐、发酵罐、制冷罐和灌装机等。
