当今使用的巴氏杀菌程序种类繁多。“低温长时间”处理是一个间歇过程，如今只被小型乳品厂用来生产一些奶酪制品。“高温短时间”处理是一个“流动”过程，通常在板式热交换器中进行，如今被广泛应用于饮用牛奶的生产。
杀菌的原理是在一定温度范围内，温度越低，细菌繁殖越慢；温度越高，繁殖越快。但温度太高，细菌就会死亡。不同的细菌有不同的最适生长温度和耐热、耐冷能力。巴氏消毒其实就是利用病原体不是很耐热的特点，用适当的温度和保温时间处理，将其全部杀灭。
巴氏杀菌机的优点
1、采用食品级不锈钢制作，设备安全、卫生.
2、采用巴氏杀菌法，能保持原有品质，保质期长。
3、采用自动温控，变频器调速，自动化流水线程度高，劳动强度低，可选配电脑全自动控制系统。
4、设备使用、维护方便，外形美观。
巴氏灭菌加热有两种形式，一是电加热，二蒸汽加热。因为巴氏灭菌法是低温杀菌。这里所说的低温只是相对高温高压杀菌机来言。是指低于100摄氏度的杀菌方式、巴氏杀菌机整机采用优质SUS304不锈钢制作，灭菌温度、速度可根据工艺要求设定。巴氏杀菌机运行平稳，噪音低，不锈钢网带强度高，伸缩性小，不易变形，易保养。
