温度对聚丙烯酰胺絮凝效果的影响也是很大的。一般来讲，随着水温的降低，聚丙烯酰胺的水解速度缓慢，颗粒的“布朗运动”强度也减弱，形成絮凝物所需时间增长;另外低温下形成的絮凝物细而松散，澄清效果变差。一般聚丙烯酰胺使用温度可在50℃以下20℃以上，效果最为理想的。但结合考虑到沉降槽内水温越高，水在沉降槽内的对流扰动就大。使用时温度过高很可能会出现聚丙烯酰胺这种水溶性聚合物出现水解现象，导致在由沉降槽中心向边缘沉降扩散过程中，即使已经絮凝成大颗粒，也会有部分受影响沉降不下从来而影响上清液的水质。所以，建议沉降槽内温度控制在30℃左右，其絮凝沉降效果能发挥得更好更出色。
