在南阳市申请地质灾害防治单位资质时，应向南阳市自然资源和规划局或其指定的审批机构提交材料。具体来说：
- **乙级和丙级资质**：通常由省一级的自然资源主管部门负责审批，因此对于南阳市的企业而言，可能需要将申请材料提交至河南省自然资源厅。不过，初步的接收和初审工作可能会由南阳市自然资源和规划局负责。
- **甲级资质**：这类资质一般由国家自然资源部直接负责审批，但申请人仍需通过地方自然资源部门逐级上报。
为了确保信息的准确性和性，建议直接联系南阳市自然资源和规划局或访问其获取的申请指南和具体要求。此外，在准备提交材料前，先咨询相关部门以了解是否有特定的流程变化或是额外的要求。这样可以确保申请过程更加顺利。
